數據交付物
生物資訊核心
典型交付成果
根據定序技術、專案類型和所需的生物資訊學支援程度，最終交付成果會有所不同。通常包括：
- 定序報告 （MS Word 文件）－一份記錄定序工作執行情況的書面報告。.
- FastQC報告 （HTML 檔案）－由 NGS 資料品質控制工具產生的報告，可在 Web 瀏覽器上檢視（僅限 Illumina 定序訪問 作者網站 詳情請見下文。.
- 分析報告 和 結果 （多種文件類型）－報告總結了分析的資料和所應用的分析流程。此外，還包括特定項目的分析結果文件（見下表）。.
- 中間分析文件 （各種文件類型）－分析過程中建立的文件，例如 Fastq 格式的過濾後的高品質 reads。交付成果取決於專案類型（見下表）。.
請在下方選擇定序技術類型，以查看交付成果。.
Illumina NovaSeq / MiSeq Sequencing – Specific Deliverables Based On Project Type
對於超出我們常規分析流程（標準交付成果）的分析需求，我們可以提供客製化協助（客製化交付成果）。請注意，以下清單並非所有可能交付成果的完整清單。如果您找不到所需內容，請與我們聯絡。最終交付成果需經CPOS與用戶雙方協商一致。.
| 項目類型 | 標準交付成果 | 客製化交付物 |
| RNA定序（mRNA） | - BAM 格式的比對文件 - 基因/轉錄本表達水平文件（MS Excel格式） - *差異表達基因/轉錄本清單（MS Excel格式）（包含與Partek Flow的整合，用於下游路徑分析） - 主成分分析圖（HTML格式，至少2個樣本） *每個送測樣本均包含 1 個成對比對。歡迎進行更多比對，詳情請與我們聯絡。. | - 以 MS Excel 格式提供的帶註釋的 SNP/INDEL 列表 - MS Excel 格式的替代剪接模式 - MS Excel 格式的融合基因文件 - MS Excel 格式的新型外顯子文件 - 其他（開放討論） |
| RNA定序（miRNA） | - BAM格式的比對文件（已知miRNA） - BAM 格式的比對文件（與其他已知 RNA，例如 snRNA、snoRNA 等） - MS Excel 格式的 miRNA 表達水平文件 - *差異表達的miRNA清單（MS Excel格式） *每個送測樣本均包含 1 個成對比對。歡迎進行更多比對，詳情請與我們聯絡。. | miRNA標靶預測 - MS Excel 格式的新型 miRNA 文件 - 其他已知RNA的表達水平 - 其他（開放討論） |
| ChIP-Seq | - BAM 格式的比對文件 - Excel格式的峰值列表 - Excel格式的註解峰列表 - BigWig 檔案用於在整合基因組瀏覽器 (IGV) 中可視化峰值 *每個送測樣本均包含 1 個成對比對。歡迎進行更多比對，詳情請與我們聯絡。. | - 其他（開放討論） |
| 人類外顯子定序 | - BAM 格式的比對文件 - 標準 VCF 格式的 SNP / INDEL 文件 - MS Excel 格式的附註釋 SNP / INDEL 檔案列表 *請點擊 在此 針對我們用於分析的目標檔案。. | - 以 MS Excel 格式提供的帶註釋的體細胞 SNP/INDEL 列表 - 針對 PHIAL 的 MS Excel 格式註釋 - 其他（開放討論） |
| 人類全基因組定序 | - BAM 格式的比對文件 - 標準 VCF 格式的 SNP / INDEL / CNV / SV 文件 - 以 MS Excel 格式提供的帶註釋的 SNP / INDEL / CNV / SV 文件列表 *分析將使用DRAGEN平台進行。. *進行體細胞拷貝數變異（CNV）檢測時，需要配對的正常樣本。請聯絡我們以了解更多詳情。. | - 其他（開放討論） |
| 亞硫酸氫鹽測序 | - BAM格式的序列比對檔案（如適用，包括人類和Lambda噬菌體） - 文字/Excel格式的註解CpG甲基化位點列表 - Lambda 的亞硫酸氫鹽轉化率（如適用） | - 其他（開放討論） |
| de novo 基因組定序 | - de novo 各種格式的組裝檔案（原始檔案和重疊群） - 文字格式的預測編碼基因文件 - 文字格式的註釋編碼基因列表 - 文字格式的重複項列表 - 非編碼RNA清單（文字格式） | - 用於基因組可視化的 Circos 圖 - 其他（開放討論） |
| de novo 轉錄組定序 | - de novo 各種格式的組裝檔案（原始檔案和重疊群） - FASTA格式的成績單列表 - 附註解的成績單清單 (GO)（Excel 格式） - 基因/轉錄本表達量（Excel格式） - *差異表達基因/轉錄本清單（Excel格式） *每個送測樣本均包含 1 個成對比對。歡迎進行更多比對，詳情請與我們聯絡。. | - 其他（開放討論） |
| 宏基因體定序 （全基因組鳥槍法） | - de novo 各種格式的組裝檔案（原始檔案和重疊群） - BLAST 檔案（原始格式），採用 BLAST 原生格式 分類樹 - 種組成（Excel格式） | - 其他（開放討論） |
| 宏基因體定序 （16s放大器） | - FASTA格式的合併雙端定序數據 - BIOM 格式的 OTU 表 - *分類概要 - *Alpha多樣性（樣本組內多樣性）的結果 - *Beta多樣性分析結果（樣本組間多樣性比較） - *Excel格式的差異OTU列表 *每個項目均包含6組間對比。歡迎提供更多比較數據，詳情請與我們聯絡。. | - 其他（開放討論） |
Pacbio Sequencing – Specific Deliverables Based On Project Type
對於超出我們常規分析流程（標準交付成果）的分析需求，我們可以提供客製化協助（客製化交付成果）。請注意，以下清單並非所有可能交付成果的完整清單。如果您找不到所需內容，請與我們聯絡。最終交付成果需經CPOS與用戶雙方協商一致。.
| 項目類型 | 標準交付成果 | 客製化交付物 |
| de novo 基因組定序 | - de novo 各種格式的組裝檔案（原始檔案和重疊群） - 文字格式的預測編碼基因文件 - 文字格式的註釋編碼基因列表 - 文字格式的重複項列表 - 非編碼RNA清單（文字格式） | - 用於基因組可視化的 Circos 圖 - 其他（開放討論） |
| 長程結構變異 | - BAM 格式的比對文件 - 結構變異清單（Excel格式） | - 其他（開放討論） |
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