常見問題解答

基因組學核心

全部/
樣品提交/
服務請求/
iLab/
非香港大學/
服務/

所有服務請求必須透過以下方式提交： iLab, 這是一個線上請求管理系統。如果您還沒有帳戶，請聯絡我們建立帳戶。.

請提前（透過電話/電子郵件）與我們的同事聯繫，然後再將樣本帶到核心實驗室。.

請隨樣品一同攜帶以下物品：

  • 對應平台的樣品提交錶紙本版（以及iLab中的電子版附件）
  • 對於DNA樣本，需提供對應分子量標記物的凝膠照片。

我們通常也為非香港大學院校提供服務。詳情請與我們聯絡。.

生物資訊核心

全部/
數據分析/
資料擷取/
Partek基因組學套件/
sFTP登入和下載/

Authentication failed; Critical error: Could not connect to server這可能是因為使用者名稱或密碼包含一些「相似」字符，例如「I」、「1」、「0」或「O」。建議您複製並貼上訊息後重新連線。.

錯誤可能是由於您的網路屏蔽了我們的 sFTP 伺服器或網路不穩定所造成的。請嘗試使用其他網路重新連線。此外，由於 Wi-Fi 連線不穩定，我們強烈建議您使用更穩定的網路連線（例如有線區域網路）下載檔案。.

此錯誤可能是由於您的電腦磁碟空間不足或網路不穩定造成的。請檢查您的硬碟是否有足夠的可用空間來儲存資料。此外，由於 Wi-Fi 連線不穩定，強烈建議您使用更穩定的網路連線（例如有線區域網路）下載檔案。.

zip.001 和 zip.002 是原始資料夾的拆分壓縮檔。只需解壓縮 zip.001，其餘壓縮檔案（如有 zip.002 和/或 zip.003）將自動解壓縮到一個資料夾中。因此，請勿解壓縮除 zip.001 以外的其他壓縮檔案。.

Cannot open the file as [zip] archive

由於從我們的 sFTP 伺服器下載失敗，檔案可能已損壞。請確保您已按照以下步驟操作： 操作說明 下載檔案並使用 WinMD5Free 驗證檔案完整性。.

Wrong password


這可能是因為使用者名稱或密碼包含一些「相似」字符，例如「I」、「1」、「0」或「O」。建議您複製並貼上密碼再次嘗試提取。.

文件可能由於解壓縮密碼錯誤而未能成功解壓縮。建議您重新複製並貼上密碼進行解壓縮。.

使用我們推薦的提取軟體（7zip通常情況下，使用 7zip 指令可以解決此錯誤。如果使用 7zip 後錯誤仍然存在，請聯絡我們。.

有關標準分析，請參閱 交付物表 我們提供不同類型的項目。如果您需要其他交付成果，請聯絡我們進行討論。.

標準生物資訊分析的周轉時間約為 2 週，前提是原始定序資料準備就緒，並且事先收到所需資訊（例如樣本物種、比較清單）。.

通常情況下，定序資料包含接頭序列。 MiSeq定序服務僅在客戶要求時才會移除接頭序列。.

如果您想移除定序資料中的接頭序列，可以參考本文中的第一對接頭序列。 網站.

閱讀 1：AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA

閱讀 2：AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT

請記得在進行下游分析之前檢查移除接頭序列後的fastq檔。.

Partek 專案在 RNA-Seq 分析中提供的文件格式將從“.ppj” 到 “.。拉鍊”「 從 2021年7月.

若要匯入項目，請點選「檔案」->「匯入」->「壓縮項目…」->選擇要匯入的項目。

PGS中的其他操作保持不變。.

若要進行指定，請點選「瀏覽」-> 選擇與您要比較的文字檔案對應的檔案。

（例如 AvsB_Partek_Gene_Diff.txt / AvsB_Partek_Isoform_Diff.txt）-> 點選「確定」。.

蛋白質體學和代謝組學核心實驗室

全部/
質譜分析/
PM核心/
蛋白質污染/
蛋白質鑑定/
服務等級/

一般來說，每個蛋白質的序列覆蓋率在 10% 到 90% 之間，這取決於蛋白質的豐度和蛋白質的性質。.

原因如下：
1. 使用與質譜檢測不相容的染色方法；;
2. 樣品中存在離子抑制試劑，如聚合物、洗滌劑和甘油；;
3. 親和純化過程中抗體等污染蛋白過載，以及血清樣本中高豐度蛋白過載；;
4. 蛋白質特有性質；例如，高度修飾的蛋白質，特定蛋白質中賴氨酸和精氨酸殘基很少。.
角蛋白是最常見的蛋白質污染物，主要來自人類皮膚和毛髮，有時也來自羊毛衫等衣物。以下是一些避免樣本受到角蛋白污染的建議：
1. 在潔淨的實驗室中工作，操作檯面乾淨；;
2. 使用封閉包裝盒內的移液管吸頭和微量離心管；;
3. 使用前用清水沖洗設備（瓶子、玻璃板、電泳設備、染色托盤）；;
4. 在樣品製備和消化過程中務必戴上手套。切勿用手指接觸凝膠。戴手套時，請勿觸摸頭髮或皮膚。.

簡單蛋白質譜分析/PTM ID 的典型週轉時間為 2 週，標靶代謝物定量（GC-MS/MS 和 LC-MS/MS）常規服務週轉時間為 3 週；蛋白質鑑定和定量（無標記蛋白質定量）週轉時間為 3 週；基於標記（TMT/iTRAQ）的蛋白質和定量週轉定量時間為 4 週齡標記。.

生物樣本庫

全部/
生物樣本庫/
管理/
限制/
服務費/
服務/
iLab/

香港大學醫學院的教職員有資格優先使用生物樣本庫服務。其他香港大學教職員可透過電子郵件查詢： biobank.cpos@hku.hk. 長期冷凍儲存僅供香港大學醫學院教職員使用。.

生物樣本庫提供 樣品儲存 服務和一些 樣品處理 服務包括從全血分離血漿/血清/白血球層、樣本分裝服務等。請發送電子郵件諮詢。 biobank.cpos@hku.hk 討論您的需求。.

這個生物樣本庫由李嘉誠醫學院建立，是其核心設施的一部分。生物樣本庫的日常運作和管理由全景組學科學中心（CPOS）-生物樣本庫核心工作人員負責。.

是的，生物樣本庫將 不是 接受以下樣品：
    1. 培養出的世衛組織風險等級3和4的微生物 在實驗室中，例如H5N1和H7N9等流感病毒株、結核分枝桿菌、伊波拉病毒、馬堡病毒、猴皰疹病毒等。.
    2. 高滴度風險組 2 的庫存 已知具有重大風險的微生物，如類鼻疽伯克氏菌、百日咳博德氏菌、白喉棒狀桿菌、腦膜炎奈瑟菌等。.
    3. 臨床或環境樣本 確認的 攜帶上述微生物。.
    4. 放射性物質

A 聲明表 在使用生物樣本庫之前，每位PI和使用者都需要簽署額外的詳細資訊。.

學院為生物樣本庫的使用提供補貼，部分營運成本將根據資源消耗收取。您可能會在“服務收費”頁面。如需其他服務，請發送電子郵件。 biobank.cpos@hku.hk 用於討論和引用。.

請仔細閱讀以下資訊。 網站, ， 然後 電子郵件 biobank.cpos@hku.hk

有助於有效跟進的資訊可能包括：

  1. 您的姓名、部門和電話號碼
  2. PI姓名、部門和信箱
  3. 樣本類型，如全血、白血球層、血漿、血清、DNA、RNA、病毒、細菌
  4. 樣本量、來源和致病性均涉及
  5. 所需的儲存條件
  6. 樣品儲存方面，目前常用的盒子/容器類型和尺寸
  7. 其他具體需求

影像和流式細胞儀核心實驗室

全部/
資料傳輸/
線上預約系統/
密碼重設/

請參閱使用者指南 這裡.

請參閱主管指南 這裡

  1. 在使用者註冊頁面註冊 http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/create_user.php
    使用任何互聯網瀏覽器。.

    • 請僅使用香港大學的電子郵件地址填寫電子郵件地址（uid@hku.hk 或者 uid@connect.hku.hk請勿使用電子郵件別名。請填寫您的全名和密碼。
    • 點擊「註冊」提交申請，系統將產生確認郵件，該郵件將發送到您的香港大學郵箱帳戶。.
  1. 請查看您註冊的信箱，找出標題為“ “CPOS成像和流式細胞儀核心網路伺服器帳戶註冊確認”.
  1. 請點選收到的電子郵件中的確認連結完成註冊。.

成像和流式細胞儀核心伺服器連接和數據上傳說明.
成像和流式細胞術核心伺服器連接和資料上傳說明 – Linux.

影像和流式細胞儀核心伺服器連接和資料下載說明 – Windows 10.

影像和流式細胞儀核心伺服器連接和資料下載說明 – Windows 7.

成像和流式細胞儀核心伺服器連接和數據下載說明 – Mac.

成像和流式細胞術核心伺服器連接和數據下載說明 – Linux.

影像和流式細胞儀核心標準操作規程 – 使用更新後的憑證在 macOS 上存取 DTS.

如需從非香港大學網路下載數據，請連線至 香港大學VPN 在伺服器中映射磁碟機之前。.

重設密碼的步驟

  1. 請使用網頁瀏覽器開啟密碼重設頁面。 http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/passwd.php
  2. 請輸入您的香港大學電子郵件地址
  3. 請查看發送到您香港大學郵箱的密碼重置郵件中的鏈接，並在該頁面輸入您的新密碼以重置密碼。

生物試劑核心

全部/
線上訂購系統/

請遵循 員工使用者指南在此 

我們提供來自 60 多個知名品牌的 20 多個類別的常用耗材和試劑，涵蓋細胞培養、微生物學、成像和流式細胞儀、分子生物學以及實驗室常規操作所需的耗材。詳細產品清單請參閱生物試劑核心線上訂購系統 (BROS)。.

歡迎提出新產品建議。請提供所需產品的詳細資訊、消費率和近期價格，以便我們與您聯絡。 bioreagent.cpos@hku.hk 供我們參考。.

配送服務涵蓋瑪麗醫院沙宣路院區內各實驗室的訂單，包括實驗室大樓、聯合生物醫學研究所（JCBIR）、中央醫學研究中心（CCMR）和中醫藥大樓。其他地點的實驗室，請在訂單確認後的5個工作天內前往核心倉庫自提。.

實驗室大樓的訂單，已確認訂單的物品將在3個工作天內送達。具體送達時間可能依實際情況調整。 QMH、JCBIR以及薩松路沿線建築的訂單，將按照線上訂購系統登入資訊中顯示的固定日期每週送貨。如有緊急取貨需求，請透過電話或電子郵件與我們聯繫。.

緊急情況下可自行取貨。服事時間為9:30-12:00；14:00-17:00。請提前透過電話或電子郵件通知我們安排自取。恕不接受直接到店自取。.

生物試劑核心實驗室簽發兩種類型的送貨單： 貨物交付單 和 送貨單.

貨物交付單 此憑證用於寄售生物試劑核心實驗室分發的物品。相應的供應商將適時向申請人開立發票。收到供應商發票後，應依直接發票流程進行採購。付款方式為：將已背書的發票提交至您所在的部門，再提交至香港大學金融工程辦公室（HKU FEO）。.

送貨單 這些憑證適用於 Bioreagent Core 零售的商品。每月初，都會發放一張憑證。 月度發票 所有在上月底前完成的訂單，都將向各組主管開立發票。費用將透過部門間轉帳的方式，從訂單中提供的資金帳戶中扣除。付款將由Core向香港大學財務辦公室提交月度匯總金額後啟動。因此，請勿將發票提交給香港大學財務辦公室。.

訂單金額超過審核限額時，應提交主管核准。為獲得訂單批准，您可以：1）在訂單中附上經批准的相應IR打印件；或2）邀請您的主管通過在線系統審批訂單，方法是將訂單提交給您的主管；或3）發送電子郵件給您的主管，請求批准採購，並抄送至bioreaeagent.cpos@hku.hk。.

如需修改發票中的收費帳戶，請發送電子郵件至 enquiry.cpos@hku.hk 自發票日期起30天內, 包括以下資訊：1）發票號碼；2）組名；3）項目申請號碼；4）新計費帳號。.

系統可以產生訂單、商品詳情、帳戶詳情、單價、總金額等的群組交易報告。若要產生報告，請在’報告‘下方點擊’群組交易報告‘，然後選擇相應的日期、供應商和群組。.

生物研究支持核心

全部/
資料傳輸/
線上預約系統/
密碼重設/

請參閱使用者指南 這裡.

請參閱主管指南 這裡

1. 在使用者註冊頁面註冊
http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/create_user.php 使用任何互聯網瀏覽器。.

  • 請僅使用香港大學的電子郵件地址填寫電子郵件地址（uid@hku.hk 或者 uid@connect.hku.hk請勿使用電子郵件別名。請填寫您的全名和密碼。
  • 點擊「註冊」提交申請，系統將產生確認郵件，該郵件將發送到您的香港大學郵箱帳戶。.
  1. 請查看您註冊的信箱，找出標題為“ “CPOS網路伺服器帳號註冊確認”.
  1. 請點選收到的電子郵件中的確認連結完成註冊。

伺服器連接和數據上傳說明.

伺服器連線與資料下載說明 – Windows 10.

伺服器連線與資料下載說明 – Mac.

生物研究支援核心標準操作規程 – 使用更新後的憑證在 macOS 上存取 DTS.

如需從非香港大學網路下載數據，請連線至 香港大學VPN 在伺服器中映射磁碟機之前。.

重設密碼的步驟

  1. 請使用網頁瀏覽器開啟密碼重設頁面。 http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/passwd.php
  2. 請輸入您的香港大學電子郵件地址
  3. 請查看發送到您香港大學郵箱的密碼重置郵件中的鏈接，並在該頁面輸入您的新密碼以重置密碼。

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