數據分析工作站
CPOS 設有 3 台 PC 使用者工作站,用於對 CPOS 產生的數據進行基因組學和蛋白質組學分析,工作站位於 6-01 室。 CPOS 技術平台的使用者可在辦公時間內前往 CPOS 接待處(6-02 室)或透過我們的線上平台預約這些工作站。 線上資源預訂系統(ORBS).
我們提供軟體入門培訓課程。請聯絡我們的平台專家以了解詳情。.
CPOS提供的分析軟體:
| 軟體 | 使用範圍 | 用戶 PC #2 工作站 * | 用戶 PC #5 工作站 | 用戶 PC #7 工作站 |
| 基因組學數據分析 | ||||
| 基因組工作室 | iScan | √ | ||
| GeneMapper 3.7 | 基因掃描 | √ | ||
| GeneMapper 6.1 | 基因掃描 | √ | ||
| PyroQ-CpG 1.0.9 | 焦磷酸定序-甲基化 | √ | ||
| PyroMark 檢測設計 2.0 | 焦磷酸定序—檢測設計 | √ | ||
| SeqScape 2.5.0 | DNA定序 | √ | ||
| 序列掃描器 | DNA定序 | √ | ||
| 安捷倫 2100 Expert | 生物分析儀 | √ | ||
| 下一代定序數據分析 | ||||
| 帶有 Partek 途徑的 Partek Genomics Suite 6.6 | Illumina資料集 | √ | ||
| 質譜分析 | ||||
| Foundation 3.1 SP9 | 代謝組學資料集 | √ | ||
| FreeStyle 1.8 SP2 QF1 | 代謝組學資料集 | √ |
* 此使用者電腦運行的是 Microsoft Windows XP 系統,且未連接網路。
指南
CPOS 的資料分析工作站主要用於支援對 CPOS 產生的資料進行分析。.
負責此類數據分析的研究人員可以註冊成為使用者。.
註冊即表示用戶同意以下準則。.
第一次分析會議前:
- 完成「線上資源預訂系統(ORBS)— 用戶帳號申請表“
- 如有需要,請聯絡對應的 CPOS 平台專家參加分析軟體入門培訓。
注意:在建立 ORBS 使用者帳戶之前,系統將驗證使用者身分。帳戶資訊將透過電子郵件發送給使用者。.
每次分析會議之前:
- 請在CPOS接待處(6-02室)或透過我們的網站預訂您的課程。 線上資源預訂系統(ORBS)
- 每位用戶最多可連續預訂 3 小時。
- 工作站開放時間:週一至週五,上午 9:30 至 12:30,下午 2:00 至 5:30(假日除外)
- 預訂採取先到先得的方式。
每次分析會話:
- 如有需要,請攜帶外部資料儲存設備和資料磁碟。
- 請到CPOS接待處(6-02室)辦理入住手續
每次分析結束後:
- 將您需要的所有資料匯出到外部資料儲存設備
- 刪除軟體內的所有資料以及暫時儲存在硬碟上的所有資料。
- 關閉電腦
其他重要提示
- 此工作站僅用於數據分析。用戶是 不允許 安裝任何軟體、執行作業系統/軟體更新或調整任何 Windows 設定。.
- 為了方便您使用,我們創建了一個名為「臨時用戶資料」的桌面資料夾,但無法保證其中儲存資料的安全性。儲存的資料將在3天後自動刪除,恕不另行通知。.
- 用戶可免費使用數據分析工作站分析CPOS產生的數據。分析外部資料則需付費,詳情請洽詢。.
軟體入門課程
我們為工作站上安裝的所有軟體提供入門課程。.
WP表格產生器
請與我們的平台專家聯繫。.
| 軟體 | 聯絡信箱 | 電話 |
| 基因組學數據分析 | ||
| PyroQ-CpG | pyroseq.cpos@hku.hk | 2831-5467 |
| 基因映射器 | sangerseq.cpos@hku.hk | 2831-5467 |
| 定序分析 | ||
| NGS數據分析 | ||
| 帶有 Partek 途徑的 Partek Genomics Suite 6.6 | bioinfo.cpos@hku.hk | 2831-5418 |
| Partek Flow 連同 Partek Pathway |
聯絡我們
bioinfo.cpos@hku.hk
核心設施
地址
六樓
香港賽馬會大樓
跨學科研究
沙遜路5號
香港薄扶林
電話:2831-5500
傳真:2818-5653
網址:https://staging1.cpos.hku.hk
電子郵件: enquiry.cpos@hku.hk
辦公時間
週一至週五:上午9:00 – 下午5:30
下午1點至2點不提供樣品及貨物接收服務
週六、週日及所有大學及公共假日休館。.



