高效能運算設施(CM-HPC)概述

該設施提供高效能運算環境,用於處理冷凍電鏡(Cryo-EM)產生的大型資料集。主要特點包括:

  1. 預先安裝軟體
    • 主要軟體已預先安裝,所有使用者均可使用。.
    • 使用者可以使用以下方式存取和切換軟體環境: 環境模組 使用簡單的命令(例如,模組加載) )。.
  2. 儲存和磁碟配額
    • 用戶將被分配磁碟空間用於儲存。.
    • 可根據需要增加或減少磁碟配額。.
    • 用戶帳戶和儲存空間均需收費。詳情請參閱網站上的收費政策。.
  3. 職位提交和資源分配
    • 工作申請透過以下方式提交: 批次作業系統 (SLURM)。.
    • 作業在可用的計算節點上執行,但需遵守最大資源使用量的限制。.
    • 如果常規作業佇列無法滿足您的需求,您可以提出申請。 自訂作業佇列 提交您的作業執行計畫和資源需求詳情。自訂佇列將在審核後短期創建,並需獲得批准。.
    • 如果您有特殊需求,請與我們聯繫,以便我們討論解決方案。所有此類請求均需視資源情況而定,並需事先獲得批准。.

關鍵命令和用法

  1. 環境模組
    • 載入軟體:模組加載
    • 卸載軟體:模組卸載
    • 列出可用軟體:模組可用
    • 列出已載入的軟體:模組列表
  2. 求職申請(SLURM)
    • 提交作業:sbatch
    • 檢查作業狀態:排隊
    • 刪除職缺:scancel

最佳實踐

  1. 優化資源利用
    • 只申請您需要的資源,避免不必要的費用。.
    • 使用高效的演算法和腳本來最大限度地減少計算時間。.
  2. 監控作業狀態
    • 定期使用佇列檢查作業狀態。.
    • 偵錯並查看失敗作業的相關日誌。.
  3. 備份重要數據
    • 定期備份數據,以避免因係統問題導致數據遺失。.

如果您有任何疑問或需要進一步協助,請隨時與我們聯絡: