服務費和訂購
單細胞標靶DNA定序
- 對每個樣本進行 5,000 至 10,000 個細胞的標靶 DNA 定序
- 可選擇預設目標面板或客製化面板
服務價格
價格受以下因素影響:
- 目標面板(預設或自訂)
- 標靶細胞數量(影響定序成本)
- 生物資訊分析的需求
- 附屬機構(香港大學、本地學者、海外學者等)
核心實驗室提供 Tapestri 封裝技術,可將細胞懸浮液中的單一細胞封裝起來,隨後進行文庫建構和 Illumina 定序。請聯絡郭欣博士(mbsinglecell.cpos@hku.hk / 2831-5483) 用於專案討論。.
服務訂購
請參考 樣品製備和提交 樣品要求部分。.
請透過以下方式提交服務請求 iLab.
技術細節
單細胞封裝
該系統能夠從單一細胞懸浮液中捕獲每個樣本 5,000 至 10,000 個細胞。.
使用者需提交每微升含 3,000 – 4,000 個細胞的細胞懸浮液,細胞大小為 30 μm 或更小,且具有良好的活力(80% 或以上)。.
在 Tapestri 儀器中,首先將細胞分離、裂解,並用蛋白酶處理以去除 DNA 結合蛋白,釋放 DNA。下一步,將裂解的細胞與條碼磁珠和試劑混合物混合,在液滴中生成帶有條碼的細胞。然後,使用多重 PCR 對目標區域進行擴增。之後,破壞液滴以釋放帶有條碼的 DNA,並添加 Illumina 接頭進行文庫擴增。純化的最終文庫即可用於定序。含有相同細胞條碼序列的文庫片段可以相互關聯。.

來源:Mission Bio
圖書館準備
該服務將包括單細胞封裝後的文庫製備。.
定序運行
產生的文庫與Illumina定序儀相容。為了讀取一端的插入序列和另一端的條碼,需要進行雙端定序。.
供應商的規格建議平均覆蓋率為 60 – 80 倍。所需的總讀取次數(以百萬計)按以下公式計算:
預期細胞數 x 擴增子數 x 建議覆蓋度
工作流程

樣品製備和提交
單細胞DNA定序所需的細胞類型
對於每個樣本,使用者需要提交一份細胞懸浮液。
– 濃度為每微升 3,000 – 4,000 個細胞
尺寸為 30 微米或更小
– 分離良好,無團塊或雙聯體
– 具備良好的生存能力(>80% 可存活)
– 重懸於不含鈣的 1x DPBS 中2+/Mg2+
樣品提交
請提前聯絡我們的同事(透過所示的電話/電子郵件)。 在此在將樣本運送到岩芯之前。.
樣品提交日期和詳情確認後,請透過以下方式提交服務請求: iLab.
請提交 單細胞(Mission Bio)樣本提交表 作為附件 iLab.
實用連結
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郭欣醫生
程莉蓮女士


