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本中心提供廣泛的生物資訊學支援服務,涵蓋各類基因組學(genomics)及轉錄組學(transcriptomics)數據分析,目前主要集中於次世代定序技術(Next Generation Sequencing, NGS)相關分析。
中心設有專責的生物資訊分析團隊,為研究人員提供標準化及客製化數據分析服務。我們於多種 NGS 項目方面擁有豐富經驗,包括 RNA-Seq、全外顯子定序(exome sequencing)、 de novo 基因組及轉錄組組裝(assembly)、宏基因組學(metagenomics)等。我們亦樂意與同事分享經驗,並就研究設計及數據分析提供專業建議。
在內部數據分析方面,我們採用多種廣泛使用的生物資訊工具及分析流程,包括 BWA、Samtools、Picard、GATK、RSEM、EBSeq、Velvet、Oases、Trinity、QIIME 等。為方便有興趣自行參與數據分析的研究人員,我們亦設有分析工作站,並提供易於使用的商業分析軟件,例如 Partek Genomics Suite,用於下游數據篩選、數據視覺化、基因集(gene set)及路徑分析(pathway analysis);以及 Partek Flow,用於單細胞 RNA-Seq 分析。
除了 NGS 生物資訊分析支援外,我們亦提供基因表達分析(gene expression)、基因分型(genotyping)、拷貝數變異分析(copy number analysis)及各類客製化分析服務。
我們亦歡迎各位同事隨時聯絡中心,進行技術交流、查詢意見,或探討合作機會。
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