高效能運算設施(CM-HPC)概述
該設施提供高效能運算環境,用於處理冷凍電鏡(Cryo-EM)產生的大型資料集。主要特點包括:
- 預先安裝軟體
- 主要軟體已預先安裝,所有使用者均可使用。.
- 使用者可以使用以下方式存取和切換軟體環境: 環境模組 使用簡單的命令(例如,模組加載) )。.
- 儲存和磁碟配額
- 用戶將被分配磁碟空間用於儲存。.
- 可根據需要增加或減少磁碟配額。.
- 用戶帳戶和儲存空間均需收費。詳情請參閱網站上的收費政策。.
- 職位提交和資源分配
- 工作申請透過以下方式提交: 批次作業系統 (SLURM)。.
- 作業在可用的計算節點上執行,但需遵守最大資源使用量的限制。.
- 如果常規作業佇列無法滿足您的需求,您可以提出申請。 自訂作業佇列 提交您的作業執行計畫和資源需求詳情。自訂佇列將在審核後短期創建,並需獲得批准。.
- 如果您有特殊需求,請與我們聯繫,以便我們討論解決方案。所有此類請求均需視資源情況而定,並需事先獲得批准。.
關鍵命令和用法
- 環境模組
- 載入軟體:模組加載
- 卸載軟體:模組卸載
- 列出可用軟體:模組可用
- 列出已載入的軟體:模組列表
- 求職申請(SLURM)
- 提交作業:sbatch
- 檢查作業狀態:排隊
- 刪除職缺:scancel
最佳實踐
- 優化資源利用
- 只申請您需要的資源,避免不必要的費用。.
- 使用高效的演算法和腳本來最大限度地減少計算時間。.
- 監控作業狀態
- 定期使用佇列檢查作業狀態。.
- 偵錯並查看失敗作業的相關日誌。.
- 備份重要數據
- 定期備份數據,以避免因係統問題導致數據遺失。.
如果您有任何疑問或需要進一步協助,請隨時與我們聯絡:
- 電話:2831-5417
- 電子郵件: itsupport.cpos@hku.hk

