生物資訊核心實驗室
如果您在連線至 sFTP 伺服器時收到「驗證失敗；嚴重錯誤：無法連線至伺服器」的錯誤訊息。
這可能是因為使用者名稱或密碼中可能包含某些「易混淆」的字元，例如「I」、「1」、「0」或「O」。建議您再次複製並貼上連線資訊。
如果您在連線至 sFTP 伺服器時遇到「ssh_init: Host does not exist; Could not connect to server」的錯誤訊息。
此錯誤可能是因為您的網路封鎖了我們的 sFTP 伺服器，或是網路連線不穩定所致。請嘗試使用其他網路重新連線。此外，由於 Wi-Fi 連線可能不穩定，強烈建議您使用更穩定的網路連線（例如有線 LAN）來下載檔案。
如果您在從 sFTP 伺服器下載檔案時收到「寫入本地檔案時發生錯誤」的錯誤訊息。
此錯誤可能是由於電腦硬碟空間不足或網路連線不穩定所致。請確認您的硬碟是否有足夠的可用空間來儲存資料。此外，由於 Wi-Fi 連線可能不穩定，強烈建議您使用更穩定的網路連線（例如有線區域網路）來下載檔案。
如果您無法使用提供的密碼解壓縮第二個 zip 檔案（zip.002）。
zip.001 和 zip.002 是原始資料夾的分割壓縮檔。只需解壓縮 zip.001，其餘的壓縮檔（如有，包括 zip.002 和/或 zip.003）將會自動解壓縮至同一個資料夾中。因此，請勿解壓縮 zip.001 以外的其他壓縮檔。
若您在解壓縮過程中遇到「無法將檔案作為 ZIP 壓縮檔開啟」的錯誤。
![無法以 [zip] 壓縮檔格式開啟此檔案](../wp-content/uploads/2021/06/BF_FAQ_DataExtractionQ2.png)
這些檔案可能是因為從我們的 sFTP 伺服器下載失敗而損壞。請確認您已按照指示下載檔案，並使用 WinMD5Free 驗證檔案完整性。
若在解壓縮過程中因「密碼錯誤」而無法解壓縮。
這可能是因為使用者名稱或密碼中可能包含某些「易混淆」的字元，例如「I」、「1」、「0」或「O」。建議您再次複製並貼上密碼以進行提取。
如果解壓縮後的檔案不含任何資料（0KB）。
檔案可能因解壓縮密碼錯誤而未能成功解壓縮。建議您再次複製並貼上解壓縮密碼。
如果您在解壓縮檔案時收到其他錯誤訊息。
使用我們推薦的解壓縮軟體（7-Zip）通常可以解決此錯誤。若使用 7-Zip 後錯誤仍未解決，請與我們聯絡。
若您想了解 CPOS 生物資訊分析服務所提供的成果。
關於標準分析，請參閱各類專案的交付成果表。若您需要額外的交付成果，請與我們聯繫以進一步討論。
如果您想了解標準生物資訊學分析的處理時間。
標準生物資訊學分析的處理時間約為兩週，前提是原始定序資料已備妥，且所需資訊（例如樣本物種、比對清單）已事先提供。
如果您想知道您的定序資料是否包含接頭序列。
一般而言，定序資料中包含接頭序列。在 MiSeq 定序服務中，接頭序列僅會在客戶要求時進行修剪。
如果您需要關於您的定序資料的接頭資訊。
若您想為定序資料修剪接頭，可參考本網站中第一對接頭序列。
讀取 1：AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCA
讀取 2：AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT
請務必在進行後續分析前，檢查經過適配器修剪的 fastq 檔案。
若您打算分析自 2021 年 7 月起在 Partek Genomics Suite 中提供的 Partek 專案，
自2021 年 7 月起，RNA-Seq 分析中提供的 Partek 專案檔案格式將由「.ppj」變更為「.zip」。
要匯入專案，請點選「檔案」→「匯入」→「壓縮專案…」→ 選擇要匯入的專案
**PGS 的其他業務維持不變。
如果您在 Partek Genomics Suite 進行路徑分析時，被要求提供「探針集註解」。
若要指定，請按一下「瀏覽」→ 選擇您要進行比對的對應文字檔
(例如：AvsB_Partek_Gene_Diff.txt / AvsB_Partek_Isoform_Diff.txt) -> 點擊「確定」。
蛋白質體學與代謝體學核心實驗室
在典型的蛋白質鑑定過程中，通常能獲得怎樣的序列覆蓋率？
一般而言，每種蛋白質的序列覆蓋率介於 10% 至 90% 之間，這取決於蛋白質的豐度及其性質。
導致質譜數據品質不佳的最常見原因有哪些？
原因如下：
1. 使用不適用於質譜檢測的染色方法；
2. 樣本中含有離子抑制試劑，例如聚合物、洗滌劑及甘油；
3. 因污染性蛋白質（例如親和純化中的抗體）及血清樣本中的高豐度蛋白質所導致的過載；
4. 蛋白質的特定性質；例如：高度修飾的蛋白質，或某種蛋白質中含極少量的賴胺酸與精胺酸殘基。
如何避免角蛋白污染？
角蛋白是最常見的蛋白質污染物，主要源自人體皮膚和頭髮，有時也來自羊毛毛衣等衣物。以下是一些避免樣本受到角蛋白污染的建議：
1. 請在實驗室環境整潔、工作檯面清潔的環境下進行操作；
2. 請使用未開封包裝中的移液管尖端及微量離心管；
3. 使用前請用清水沖洗器材（試管、玻璃板、電泳設備、染色盤）；
4. 進行樣本製備和消化時，請務必全程佩戴手套。切勿用手指觸碰凝膠。戴著手套的手，請勿觸碰頭髮或皮膚。
我何時能拿到檢驗結果？
一般而言，簡單的蛋白質譜分析／蛋白質修飾（PTM）鑑定，以及針對性代謝物定量（GC-MS/MS 和 LC-MS/MS）等常規服務，週期為 2 週；蛋白質鑑定與定量（無標記蛋白質定量）為 3 週；標記法（TMT/iTRAQ）蛋白質鑑定與定量為 4 週；標記法磷蛋白質體學服務則為 6 週。
生物樣本庫
哪些人可以使用本院教職員生物樣本庫？
香港大學醫學院的教職員有資格優先使用生物樣本庫服務。其他香港大學教職員可透過電郵查詢：biobank.cpos@hku.hk。長期冷凍儲存服務僅限香港大學醫學院的教職員使用。
生物樣本庫提供哪些類型的服務？
生物樣本庫提供樣本儲存服務及部分樣本處理服務，例如從全血中分離血漿／血清／白細胞層，以及樣本分裝服務等。如有需求，請發送電子郵件至 biobank.cpos@hku.hk與我們聯繫。
生物樣本庫是如何管理的？
生物樣本庫由香港大學醫學院設立，作為其核心設施的一部分。生物樣本庫的日常運作與管理由全景科學中心（CPOS）——生物樣本庫核心團隊負責。
生物銀行儲存的樣本是否有任何限制？
是的，生物樣本庫將不接受以下樣本：
-
- 在實驗室中培養的世界衛生組織第3類及第4類高風險微生物，例如：H5N1及H7N9等流感病毒株、結核分枝桿菌、伊波拉病毒、馬堡病毒、猴疱疹病毒等。
- 已知具有顯著風險的第 2 類風險群微生物的高滴度菌株，例如：假結核伯克霍德菌、百日咳博德特氏菌、白喉棒狀桿菌、腦膜炎奈瑟菌等。
- 經確認攜帶上述微生物的臨床或環境樣本。
- 放射性物質
在使用生物樣本庫之前，每位研究負責人及使用者均須簽署一份載有詳細資訊的聲明書。
這要多少錢？
本院提供生物樣本庫的使用補助，惟部分營運成本將依據實際消耗之資源進行收費。您可於「服務費用」頁面查閱部分標準收費項目。如需其他服務，請發送電子郵件至 biobank.cpos@hku.hk進行洽詢及報價。
如果我想使用生物樣本庫，該如何開始？
請詳閱本網站上的資訊，然後發送電子郵件至 biobank.cpos@hku.hk
有助於有效跟進的資訊可能包括：
- 您的姓名、所屬部門及電話號碼
- 研究負責人姓名、所屬部門及電子郵件
- 樣本類型，例如：全血、白細胞層、血漿、血清、DNA、RNA、病毒、細菌
- 樣本規模、來源及相關致病性
- 所需儲存條件
- 關於樣本儲存，現行箱體／容器類型與尺寸
- 其他特定需求
影像與流式細胞術核心實驗室
使用者該如何使用 PPMS？
請參閱此處的使用者指南。
身為主管，該如何運用 PPMS？
請參閱此處的指導員指南
如何註冊以取得影像與流式細胞術核心數據傳輸伺服器的存取權限？
- 請至使用者註冊頁面進行註冊 http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/create_user.php
使用任何網路瀏覽器。- 請僅填寫香港大學的電子郵件地址（uid@hku.hk或uid@connect.hku.hk），請勿使用電子郵件別名。請填寫您的全名及密碼
- 請點擊「註冊」以提交申請，系統將生成一封確認電郵並發送至您的港大電郵帳戶。
- 請查閱您的註冊信箱，尋找標題為「CPOS 影像與流式細胞術核心網路伺服器帳戶註冊確認」的電子郵件。
- 請點擊收到的電子郵件中的確認連結，以完成註冊。
如何將資料上傳至影像與流式細胞術核心伺服器？
如何從影像與流式細胞術核心伺服器下載資料？
影像與流式細胞術核心服務器連線及資料下載說明 – Windows 10。
影像與流式細胞術核心服務器連線與資料下載說明 – Windows 7。
影像與流式細胞術核心實驗室伺服器連線與資料下載說明 – Mac。
影像與流式細胞術核心服務器連線與資料下載說明 – Linux。
影像與流式細胞術核心實驗室標準作業程序 – 在 macOS 上使用更新後的憑證登入 DTS。
若要從香港大學校外網路下載資料，請在伺服器上建立磁碟機映射之前，先連線至HKUVPN。
如何重設影像與流式細胞術核心實驗室資料傳輸伺服器的密碼？
重設密碼的步驟
- 請使用網路瀏覽器開啟密碼重設頁面：http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/passwd.php
- 請輸入您的港大電郵地址
- 請點擊發送至您港大電子信箱的密碼重設電郵中的連結，並在該頁面輸入新密碼以重設密碼
生物試劑核心實驗室
如何在線上訂購系統中下單？
核心區目前陳列哪些商品？
我們提供來自 60 多個知名品牌的 20 多種常見耗材與試劑，涵蓋細胞培養、微生物學、影像與流式細胞術、分子生物學以及實驗室常規操作所需的實驗室耗材。詳細品項清單請參閱生物試劑核心線上訂購系統（BROS）。
能否在 BR Core 中新增項目？
歡迎提供新商品建議。請提供您期望的產品詳情、消費率及近期價格，並聯絡bioreagent.cpos@hku.hk供我們評估。
送貨服務的服務範圍是哪裡？
此配送服務適用於瑪麗醫院薩松路院區內各實驗室的訂單，包括實驗室大樓、JCBIR、CCMR 及中醫大樓。若實驗室位於其他地點，請於訂單確認日起 5 個工作天內，自行至核心倉庫取貨。
確認訂單後，我何時能收到商品？
針對實驗室大樓的訂單，已確認訂單中的商品將於 3 個工作天內送達。實際送貨時間可能因情況而異。至於來自 QMH、JCBIR 以及沙宣路沿線大樓的訂單，將依照線上訂購系統登入訊息中所示的固定日期，提供每週送貨服務。如需緊急取貨，請透過電話或電子郵件與我們聯繫。
何時可以親自領取商品？
如有緊急情況，可選擇親自取貨。服務時間為 9:30-12:00；14:00-17:00。請事先透過電話或電子郵件通知我們，以便安排取貨事宜。恕不接受未預約的現場取貨請求。
Core 的交貨單 (DN) 和月結單需要哪些程序？
試劑核心實驗室開立的送貨單共有兩種類型：寄售送貨單與送貨單。
針對由生物試劑核心設施分發的寄售物品，將開立寄售交貨單。相關供應商將於適當時機向申請人開立發票。收到供應商發出的發票後，應將該發票視為採購的直接發票進行處理。付款程序應透過將經核可的發票提交至所屬部門，再轉交香港大學財務處（FEO）來啟動。
針對由生物試劑核心設施零售的物品，將開立交貨單。每月月初，本設施將針對上月底前彙總的所有訂單，向各組主管開立月結單。相關費用將透過部門間轉帳，從訂購時提供的經費帳戶中結算。付款程序將由核心設施向香港大學財務處提交月度彙總金額後啟動。因此，請切勿將發票提交至香港大學財務處。
總金額超過核准限額時該如何下單？將訂單提交給主管後，我該怎麼做？
金額超過核准限額的訂單，應提交給主管審批。若要獲得訂單核准，您可以：1) 在訂單中附上經核可的相關採購授權書（IR）副本；2) 透過線上系統將訂單提交給主管，請其核准；3) 發送電子郵件給主管申請採購核准，並將 bioreaeagent.cpos@hku.hk 設為副本（cc）。
如何在發票中變更付款帳戶？
如需修改發票中的帳戶資訊，請於發票日期起 30 天內發送電子郵件至enquiry.cpos@hku.hk，並提供以下資訊：1) 發票編號 2) 集團名稱 3) 項目申請編號 4) 新的帳戶編號
如何檢視各組的訂單與費用？
系統可針對訂單、項目明細、帳戶明細、單價、總金額等生成「群組交易報表」。要生成此報表，請點擊「報表」下的「群組交易報表」，並選擇適當的日期、供應商及群組。
生物研究支援核心
使用者該如何使用 PPMS？
請參閱此處的使用者指南。
身為主管，該如何運用 PPMS？
請參閱此處的指導員指南
如何註冊以取得核心資料傳輸伺服器的存取權限？
1. 請使用任何網路瀏覽器，前往使用者註冊頁面
http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/create_user.php進行註冊。
- 請僅填寫香港大學的電子郵件地址（uid@hku.hk或uid@connect.hku.hk），請勿使用電子郵件別名。請填寫您的全名及密碼
- 請點擊「註冊」以提交申請，系統將生成一封確認電郵並發送至您的港大電郵帳戶。
- 請查閱您的註冊信箱，尋找標題為「CPOS 網路伺服器帳戶註冊確認」的電子郵件。
- 請點擊收到的電子郵件中的確認連結，以完成註冊
如何將資料上傳至核心伺服器？
如何從核心伺服器下載資料？
生物研究支援核心標準作業程序 – 在 macOS 上使用更新後的憑證存取 DTS。
若要從香港大學校外網路下載資料，請在伺服器上建立磁碟機映射之前，先連線至HKUVPN。
如何重設 Core 資料傳輸伺服器的密碼？
重設密碼的步驟
- 請使用網路瀏覽器開啟密碼重設頁面：http://ifcs.staging1.cpos.hku.hk/share-drive/passwd.php
- 請輸入您的港大電郵地址
- 請點擊發送至您港大電子信箱的密碼重設電郵中的連結，並在該頁面輸入新密碼以重設密碼
